กระทรวงเกษตรและสหกรณ์ได้จัดตั้งสำนักงานเกษตรและสหกรณ์จังหวัดสกลนครเป็นส่วน
ราชการบริหารส่วน ภูมิภาค ของสำนักงานปลัดกระทรวงเกษตรและสหกรณ์ตามพระราชกฤษฎีกาแบ่งส่วนราชการ สำนักงานปลัดกระทรวงเกษตรและสหกรณ์ พ.ศ.2538 โดยประกาศในราชกิจจานุเบกษา ฉบับกฤษฎีกา เล่มที่ 112 ตอนที่ 6 ก วันที่ 7 กุมภาพันธ์ 2538 หน้า 7 มีอำนาจหน้าที่และความรับผิดชอบในด้านการจัดทำและประสานแผนพัฒนาและแผน ปฏิบัติงานด้านการเกษตรและสหกรณ์ภายในจังหวัด กำกับ ดูแล และประสานการปฏิบัติงานโครงการพัฒนาการเกษตรและสหกรณ์ที่มีหลายส่วนราชการ ร่วมกัน ติดตามประเมินผลการพัฒนาการเกษตรและสหกรณ์ภายในจังหวัด เป็นศูนย์ข้อมูลด้านการเกษตรและสหกรณ์ในระดับจังหวัด โดยมีเกษตรและสหกรณ์ปฏิบัติงานในฐานะผู้แทนกระทรวง เกษตรและสหกรณ์ ประจำจังหวัด
การบริหารงานของสำนักงานเกษตรและสหกรณ์จังหวัด ในฐานะผู้แทนกระทรวงเกษตรและสหกรณ์ประจำจังหวัด ตามระเบียบบริหารราชการแผ่นดิน พ.ศ.2534 กำหนดให้ผู้แทนกระทรวงเกษตรและสหกรณ์เป็นกรรมการจังหวัด (กจ.) และระเบียบสำนักนายกรัฐมนตรีว่าด้วยการพัฒนาชนบทและการกระจายความเจริญสู่ภู มิภาคพ.ศ.2535 ทำหน้าที่เป็นคณะกรรมการพัฒนาจังหวัด (กพจ.) รวมทั้งเป็นศูนย์กลางบริหารงานของกระทรวงเกษตรและสหกรณ์ในจังหวัด และยังเป็นที่ปรึกษาทางด้านการเกษตรของกระทรวงเกษตรและสหกรณ์ในส่วนภูมิภาค จึงจำเป็นต้องมียุทธศาสตร์การบริหารงาน เพื่อใช้เป็นแนวทางในการปฏิบัติงานของเจ้าหน้าที่และใช้ในการบริหารการ พัฒนาการเกษตรและสหกรณ์ในจังหวัด ให้บรรลุตามบทบาทหน้าที่ของสำนักงานฯ และสนองนโยบายของรัฐอย่างมีประสิทธิภาพสูงสุด
ปี พ.ศ. 2540 สำนักงานมาจัดตั้งอยู่ด้านทิศตะวันออก ของศาลากลางจังหวัดสกลนคร
ปี พ.ศ. 2542 ย้ายสำนักงานเข้าศาลากลางจังหวัดสกลนคร ชั้นสอง ซึ่งเดิมเป็นห้องจ่าจังหวัด
ปัจจุบัน สำนักงานเกษตรและสกรณ์จังหวัดสกลนคร ตั้งอยู่ในศาลากลางจังหวัดสกลนคร ชั้น 2 หลังเก่า ถนนศูนย์ราชการ ตำบลธาตุเชิงชุม อำเภอเมือง จังหวัดสกลนคร